Існує корисний інструмент rabbitmqadmin для керування RabbitMQ.
Отримати його можна тут він входить в склад management plugin, котрий дозволяє робити все теж саме через веб інтерфейс. Також, що буде більш правильно, можна встановити management plugin і отримати rabbitmqadmin на сторінці http://ім'я-серверу:15672/cli/
Для очистки черги можна виконати команду:
rabbitmqadmin purge queue name=<ім'я_черги>